股權(quán)確認糾紛的申請訴訟可以按照以下步驟進行：

1. 資料準備：收集與股權(quán)確認糾紛相關(guān)的所有證據(jù)、合同、協(xié)議等文件，并準備妥當，確保申請訴訟所需的資料完整。

2. 咨詢律師：尋求專業(yè)律師的建議和幫助，咨詢律師可對案件的法律性質(zhì)、適用法律和訴訟程序提供指導，并代表您進行訴訟。

3. 提起訴訟：將準備好的申請訴訟材料提交給相關(guān)法院，包括起訴狀、證據(jù)材料等。起訴狀應當明確表述糾紛的事實、請求和理由，陳述清楚自己的訴求。

4. 立案審查：法院將對申請訴訟材料進行立案審查，確保起訴符合法定條件。法院會確認當事人的身份、糾紛事實和爭議的對象等，并決定是否受理該案。

5. 庭前準備：法院受理案件后，會安排庭前準備活動，如調(diào)解、送達等。當事人應積極參與庭前活動，提供協(xié)助，并準備好辯護材料等。

6. 庭審階段：經(jīng)過庭前準備工作后，法院將安排庭審時間。當事人需按時出席，提供證據(jù)及進行辯論。法庭將依法審理案件，聽取雙方當事人的陳述和辯論，并最終作出裁決。

7. 裁決執(zhí)行：如果法院作出有利于您的裁決，對方不服裁決的，可以提起上訴。如果裁決確定生效，對方不履行義務，則可申請強制執(zhí)行。

需要注意的是，具體的申請訴訟流程可能因不同國家和地區(qū)的法律制度而有所不同，建議在具體操作前咨詢專業(yè)律師的意見。