農村兩層房屋拆遷的補償一般會考慮以下幾個因素：

1. 房屋面積：補償金額可能會根據原房屋的面積進行計算，一般是以每平方米的價格進行補償。

2. 土地價值：如果房屋所在土地的價值較高，補償金額可能會提高。

3. 遷移費用：如果需要遷移到新建的住房或者購買其他住房，補償金額可能會考慮遷移費用。

4. 勞動力補償：如果房屋的拆除導致居民失去了原有生產生活條件，補償金額可能會考慮對于勞動力的補償。

5. 房屋狀況：如果房屋的狀況較好，補償金額可能會相應提高。

具體的補償標準可能會根據當地政府的相關規(guī)定而有所不同，一般由相關拆遷部門負責具體的評估和補償方案的制定。