在拆遷過(guò)程中，如果房屋擁有合法的建設(shè)許可證、房產(chǎn)證等一切合法手續(xù)，通常情況下不會(huì)被認(rèn)定為違建。然而，在某些情況下，即使擁有證件，房屋仍有可能被認(rèn)定為違建。

首先，如果拆遷時(shí)發(fā)現(xiàn)房屋存在規(guī)模超標(biāo)、布局不合理、高度超限、違反建筑安全規(guī)范等問題，房屋可能被認(rèn)定為違建。這種情況下，即使房屋有證件，仍然不能避免違建的認(rèn)定。

其次，如果房屋是在沒有獲得合法建設(shè)許可證的情況下擅自搭建或改建，即所謂的“黑房”，那么這種房屋就會(huì)被認(rèn)定為違建。即使后來(lái)拿到了建設(shè)許可證，但在沒有許可證的情況下進(jìn)行的建設(shè)或改建仍然是違法的。

此外，如果房屋的位置與規(guī)劃要求不符，例如在環(huán)保、安全、交通等不允許建設(shè)的區(qū)域，那么房屋也會(huì)被認(rèn)定為違建。即使擁有一切證件手續(xù)，房屋違反規(guī)劃要求的事實(shí)并不會(huì)改變。

綜上所述，拆遷時(shí)是否有證房屋不一定能避免違建的認(rèn)定。盡管有證件，但如果房屋存在違規(guī)、超標(biāo)、無(wú)許可證等問題，仍然有可能被認(rèn)定為違建。因此，在進(jìn)行建設(shè)或購(gòu)買房屋時(shí)，應(yīng)注意遵守相關(guān)法規(guī)規(guī)定，確保房屋的合法性。