股權糾紛主要涉及股東之間的權益和利益分配，一旦發(fā)生糾紛，可以通過以下方式在法院進行處理：

1. 提起訴訟：當股權糾紛無法通過協(xié)商解決時，一方可以向法院提起訴訟。起訴的一方需提交相關證據(jù)，以證明對方在股權分配、權益保護等問題上存在違法行為。

2. 證據(jù)調(diào)查：法院在受理股權糾紛案件后，會開展證據(jù)調(diào)查工作，采集相關證據(jù)、調(diào)查事實，以確定糾紛的真實性和有關責任方。

3. 調(diào)解：在股權糾紛案件訴前、訴中或者訴后的任意階段，法院可以組織適當?shù)恼{(diào)解工作，促使雙方達成和解協(xié)議。

4. 審理：當調(diào)解無法達成協(xié)議或一方拒絕調(diào)解時，法院將根據(jù)相關證據(jù)進行正式審理。審理過程中，法院會充分聽取雙方意見，并對雙方提出的證據(jù)進行審核。

5. 判決：根據(jù)審理的結(jié)果，法院將做出相應的判決。判決可能包括股權歸屬、利益分配、損害賠償?shù)葍?nèi)容。判決書具有法律效力，雙方需按照判決履行相應義務。

6. 上訴和執(zhí)行：如果一方對判決結(jié)果不滿意，可以在規(guī)定時間內(nèi)向上級法院提起上訴。同時，獲得判決的一方可以向法院申請強制執(zhí)行，確保判決的執(zhí)行結(jié)果。

需要注意的是，股權糾紛案件的處理過程可能會因各地法律規(guī)定和實際情況有所不同，具體處理方式還需根據(jù)法院的具體規(guī)定和程序進行。在糾紛解決過程中，雙方應積極配合法院的調(diào)查取證工作，提供充分的證據(jù)，以確保糾紛得到公正、合法的解決。同時，雙方也可以選擇委托專業(yè)律師代理，以維護自身權益并獲得更好的訴訟結(jié)果。