農(nóng)業(yè)用地建廠房拆遷的計算方法主要涉及兩個方面的費用：拆遷補償費用和土地使用權轉(zhuǎn)讓費用。

1. 拆遷補償費用：根據(jù)相關法律法規(guī)，農(nóng)業(yè)用地建廠房拆遷涉及到失地農(nóng)民的補償費用。補償費用主要包括被拆遷土地的面積、土地等級、土地升值額、后備負荷等。其中，土地面積是基礎，其他因素按照當?shù)赝恋毓芾聿块T的規(guī)定計算。

2. 土地使用權轉(zhuǎn)讓費用：一般情況下，農(nóng)業(yè)用地建廠房拆遷后，土地使用權需轉(zhuǎn)讓給廠房的使用方。轉(zhuǎn)讓費用一般按照土地資源評估價格來確定。評估價格主要根據(jù)土地市場價格、土地的等級、土地的地理位置等多個方面來決定。

在計算農(nóng)業(yè)用地建廠房拆遷費用時，一般是將拆遷補償費用和土地使用權轉(zhuǎn)讓費用相加得出。具體費用會根據(jù)當?shù)卣嚓P規(guī)定和土地管理部門的具體要求而有所不同，所以在實際操作中需要咨詢當?shù)叵嚓P部門，了解具體計算方法和標準。