拆遷商鋪補償工廠的方式一般有以下幾種：

1. 經(jīng)濟補償：拆遷方可以根據(jù)工廠的價值和產(chǎn)權情況，向工廠支付合理的經(jīng)濟補償款項。這個金額可以根據(jù)工廠的規(guī)模、生產(chǎn)能力、市場價值等因素進行評估。

2. 土地調(diào)配：如果拆遷方有其他適合工廠使用的土地資源，可以將這些土地調(diào)配給工廠。在土地調(diào)配過程中，拆遷方可以給予合理的優(yōu)惠條件，比如優(yōu)先購地、租金減免等。

3. 轉產(chǎn)安置：拆遷方可以協(xié)助工廠進行轉產(chǎn)，幫助工廠重新安置生產(chǎn)設備和流程，并提供相應的支持和補貼，以確保工廠能夠順利實現(xiàn)產(chǎn)能轉移。

4. 股權或合作：拆遷方可以與工廠達成合作協(xié)議，共同經(jīng)營新的商業(yè)項目，或者將工廠變成拆遷方新項目的一部分，以實現(xiàn)雙贏的局面。

綜上所述，拆遷商鋪補償工廠的方式有多種，可以根據(jù)雙方的具體情況和需求進行協(xié)商確定最佳方案。