如果宅基地拆遷房屋有糾紛，可以采取以下幾種處理方式：

1. 協(xié)商解決：雙方可通過平等協(xié)商，就房屋拆遷問題尋求共識(shí)，商討解決方案，達(dá)成互利共贏的協(xié)議。

2. 調(diào)解調(diào)處：可以請(qǐng)相關(guān)部門、社區(qū)或鄉(xiāng)鎮(zhèn)政府等作為調(diào)解方，通過公正中立的第三方調(diào)解，促進(jìn)雙方達(dá)成和解。

3. 申請(qǐng)仲裁：如果協(xié)商或調(diào)解解決不了糾紛，可以向相關(guān)仲裁機(jī)構(gòu)提交申請(qǐng)，由仲裁機(jī)構(gòu)進(jìn)行公正的仲裁，裁決一方履行相應(yīng)義務(wù)。

4. 提起訴訟：如果糾紛嚴(yán)重且無法通過協(xié)商、調(diào)解、仲裁解決，受影響的一方可以通過法律途徑向法院提起訴訟，尋求司法解決。

無論采取何種方式，建議雙方保留好相關(guān)證據(jù)材料，確保自身利益。同時(shí)，如果不清楚相關(guān)法律法規(guī)，可以咨詢律師，獲取專業(yè)的法律意見。