股權(quán)糾紛是指在股權(quán)交易、公司治理、股東權(quán)益等方面產(chǎn)生的爭議和糾紛。其案由主要包括以下幾個方面。

首先，股權(quán)轉(zhuǎn)讓糾紛是股權(quán)糾紛的主要案由之一。在公司發(fā)展過程中，股東之間可能根據(jù)自身需求出售或轉(zhuǎn)讓股權(quán)，但因為股東之間的利益分配、價格確定等因素，可能導致爭議和糾紛。

其次，公司治理糾紛也是股權(quán)糾紛的重要案由。公司治理是指公司內(nèi)部管理機制與關系的規(guī)范，包括董事會、監(jiān)事會、股東大會等，在這個過程中，可能存在管理權(quán)力、信息披露、利益沖突等問題，從而導致糾紛的產(chǎn)生。

第三，股東權(quán)益保護案由也常見于股權(quán)糾紛中。在公司運營過程中，股東的合法權(quán)益可能受到侵害，例如其他股東濫用權(quán)力、欺詐行為等，這些都會引發(fā)糾紛。

此外，股東之間的合作關系問題也是股權(quán)糾紛案由的一部分。例如，股東合伙關系、股東協(xié)議等合作關系因各種原因發(fā)生矛盾，也可能引起股權(quán)糾紛。

最后，由于股權(quán)交易在市場經(jīng)濟中具有重要的地位，如果市場環(huán)境復雜、監(jiān)管不夠完善，也可能產(chǎn)生侵權(quán)行為和欺詐行為，從而導致股權(quán)糾紛。

總之，股權(quán)糾紛案由多種多樣，涉及到股權(quán)轉(zhuǎn)讓、公司治理、股東權(quán)益保護、股東合作關系以及市場環(huán)境等諸多因素。在保護各方權(quán)益的同時，加強監(jiān)管、完善法律法規(guī)體系，對于避免和處理股權(quán)糾紛具有重要意義。