房產糾紛代理收費的合法性是一個復雜的問題，因為涉及到不同的法規(guī)和司法解釋。然而，一般來說，房產糾紛代理收費是合法的，但需要符合相關法規(guī)和合同約定。

首先，根據(jù)《中華人民共和國律師法》，律師可以代理當事人處理房產糾紛案件，并按照約定收取法律服務費。這意味著律師代理房產糾紛案件收費是合法的，但需要律師和當事人在合同中明確收費標準和方式。

其次，根據(jù)《中華人民共和國合同法》，當事人可以自由約定合同內容，包括代理收費的約定。如果在合同中明確規(guī)定了代理收費的標準和方式，并且雙方自愿簽訂了合同，代理收費也是合法的。

然而，需要提醒的是，代理收費的合法性并不意味著代理人可以隨意收費。代理人在收取費用時必須合理、公正，并且需要提供相應的服務。如果代理人擅自提高收費標準、收取不合理費用或未履行相應的服務，可能會被認定為違反法律規(guī)定并遭到追究。

因此，當事人在選擇房產糾紛代理時，應仔細對待代理合同中的收費約定，確保收費標準合理，并保留相關證據(jù)以便維權。同時，代理人也應當遵守法律規(guī)定，確保代理收費的合法性和公正性。