專利代理合同糾紛可以通過以下幾種方式解決：

1. 協(xié)商解決：雙方可以坐下來協(xié)商，通過友好的方式解決爭議。雙方可以找到一個共同的解決方案，并簽署一份補充協(xié)議來修正原有的合同。

2. 仲裁解決：雙方可以選擇將糾紛提交給獨立的第三方仲裁機構(gòu)來進行調(diào)解和裁決。仲裁通常較為迅速，并且具有一定的法律約束力。

3. 訴訟解決：如果協(xié)商和仲裁都無法解決糾紛，雙方可以選擇通過法律途徑解決。任何一方都可以向法院提起訴訟，等待法院判決。這種方式通常比較費時和費用較高。

無論選擇何種方式，解決糾紛的關(guān)鍵是及時溝通、保持冷靜和明確雙方的權(quán)益和責任。雙方應該傾聽對方的觀點，并尋求一個雙方都可以接受的解決方案，以避免進一步的法律和經(jīng)濟糾紛。