民事合同糾紛開庭時，處理方式主要包括以下幾個步驟：

1. 審理程序：開庭時，首先由法官宣布開庭，并確認訴訟參與人的身份。法官會要求當事人進行案件事實和爭議點的陳述，同時會允許雙方當事人陳述自己的觀點并提供證據(jù)。在證據(jù)交換階段，法官會根據(jù)雙方提供的證據(jù)進行鑒定并提問。

2. 案件調(diào)解：在開庭過程中，法官可能會進行調(diào)解，以促使雙方當事人自愿達成和解。調(diào)解過程是基于法律和事實的，法官會通過提出問題和引導雙方當事人進行討論以推動和解，當事人可以根據(jù)法官的建議進行調(diào)整。

3. 發(fā)言辯論：開庭過程中，法庭將給予雙方當事人充分的發(fā)言機會，雙方可以分別發(fā)表意見并辯論自己的觀點。在發(fā)言過程中，應注意尊重法庭、尊重法官、尊重對方當事人，并提出準確、具體的事實和理由來支持自己的觀點。

4. 證據(jù)質(zhì)證：雙方當事人可以提供書證、物證、證人證言等證據(jù)來支持自己的主張。在開庭時，法庭會對雙方的證據(jù)進行質(zhì)證，雙方當事人可以對對方的證據(jù)提出異議，并將證據(jù)的真實性、合法性等問題提供給法庭進行審查。

5. 法官裁決：在聽取雙方的陳述和證據(jù)后，法官會根據(jù)法律和事實作出適當?shù)牟脹Q。根據(jù)情況，法官可能會當庭宣判或宣布將判決結果擇期宣判。

總之，民事合同糾紛開庭處理需要遵循法定程序，雙方當事人應尊重法庭和法官，積極參與辯論和證據(jù)提供，并遵循法庭的決定。如有不服，可以進行上訴。