處理兩份合同糾紛的方法主要有以下幾種：

1. 協(xié)商解決：首先雙方應當通過友好協(xié)商的方式嘗試解決糾紛。雙方可以就爭議的事項進行討論和妥協(xié)，尋求達成共識，并簽訂補充協(xié)議或合同修訂協(xié)議。

2. 調解解決：如果協(xié)商無法解決糾紛，雙方可以選擇向第三方調解機構或調解員尋求調解。調解員會發(fā)揮中立的作用，在雙方之間促成和解，并達成調解協(xié)議，雙方則按照調解協(xié)議執(zhí)行。

3. 仲裁解決：如果協(xié)商和調解都無法解決糾紛，雙方可以選擇通過仲裁來解決。雙方可以根據合同中的仲裁條款選擇合適的仲裁機構，遞交仲裁申請。仲裁員會根據雙方的陳述和證據進行裁決，裁決結果具有法律效力。

4. 起訴解決：如果協(xié)商、調解和仲裁都無法解決糾紛，雙方可以選擇提起訴訟，將糾紛提交給法院進行審理。法院會根據法律和事實判斷，做出最終判決。

無論采用何種解決方式，雙方應當保持溝通和理解，并盡可能以減少損失和維護雙方合法權益為目標，確保糾紛得到及時有效的解決。此外，建議在簽訂合同時，注意條款的明確性和完整性，以避免日后發(fā)生糾紛的可能性。