合同糾紛賠款的記賬需要分別按照財(cái)務(wù)憑證和會(huì)計(jì)科目記賬：

首先，在公司財(cái)務(wù)憑證方面，記賬需要記錄以下內(nèi)容：

1. 根據(jù)雙方達(dá)成的賠償協(xié)議，確定賠款金額；

2. 在公司財(cái)務(wù)憑證中，以“賠款”為摘要，填寫賠償款項(xiàng)的具體金額；

3. 在借方欄填寫該筆賠償款項(xiàng)，表示公司收到的賠償款的資金流入；

4. 在貸方欄填寫相應(yīng)的收入科目，如“合同糾紛賠償收入”，表示該賠償款項(xiàng)是公司的收入；

5. 根據(jù)實(shí)際情況，填寫其他必要的信息，如對(duì)方單位名稱、合同糾紛的具體事由等。

其次，在會(huì)計(jì)科目上，一般可將合同糾紛賠款的記賬分為兩個(gè)步驟：

1. 賠款的收入記賬：若賠款被認(rèn)為是公司的收入，應(yīng)將賠償款以對(duì)應(yīng)的科目借記，常見的科目可能包括“其他應(yīng)收款”、“合同糾紛賠款收入”等；

2. 賠款的支出記賬：若賠款是公司的支出，需要將賠償款以對(duì)應(yīng)的科目貸記，常見的科目可能包括“應(yīng)付賬款”、“合同糾紛賠款支出”等。

記賬時(shí)應(yīng)準(zhǔn)確填寫摘要、金額、科目等信息，并及時(shí)記錄在公司的財(cái)務(wù)賬簿中，以便于后續(xù)的財(cái)務(wù)核算和報(bào)表編制。另外，在記錄賠償款的同時(shí)，建議妥善保存相關(guān)的合同糾紛協(xié)議等相關(guān)文件，以備日后查閱。