股票轉(zhuǎn)讓合同糾紛的處理需要根據(jù)具體情況來確定，一般有以下幾種途徑：

1. 協(xié)商解決：雙方可以通過對(duì)話、談判等方式，協(xié)商解決合同糾紛。雙方可以找到一個(gè)互利的共同點(diǎn)，達(dá)成解決糾紛的協(xié)議。

2. 申請(qǐng)仲裁：如果協(xié)商無(wú)果，雙方可以向仲裁機(jī)構(gòu)申請(qǐng)仲裁。仲裁是一種非訴訟的爭(zhēng)議解決方式，由專業(yè)的仲裁員進(jìn)行裁決，并對(duì)雙方具有法律約束力。

3. 提起訴訟：如果仲裁無(wú)法解決糾紛，雙方可以選擇向法院提起訴訟。在訴訟程序中，法院將依法審理雙方的爭(zhēng)議，并最終做出判決。

無(wú)論采取哪種方式解決糾紛，雙方應(yīng)保留好相關(guān)的證據(jù)和文件，以便在解決糾紛時(shí)提供給相關(guān)機(jī)構(gòu)或者法院。此外，在處理股票轉(zhuǎn)讓合同糾紛時(shí)，可以咨詢專業(yè)的律師或者法律顧問，以獲取合法、公正的意見和建議。