淘寶店鋪合同糾紛可以通過以下渠道進行起訴：

1. 電子商務仲裁平臺：淘寶網提供了電子商務仲裁服務，對于淘寶店鋪合同糾紛，可以提交仲裁申請，并經過專業(yè)調解員的調解處理。

2. 法院訴訟：如果通過仲裁未能解決糾紛，可以通過法院提起訴訟。根據合同糾紛的具體金額大小和地域不同，選擇合適的法院進行訴訟。

需要注意的是，根據電子商務法的規(guī)定，對于電子商務交易糾紛，可以選擇通過仲裁或法院訴訟解決。建議在選擇起訴途徑前，詳細了解相關法律法規(guī)，并在有需要的情況下咨詢專業(yè)法律意見。