證券合同糾紛主要可以通過(guò)以下幾種方式進(jìn)行處理：

1. 協(xié)商解決：雙方當(dāng)事人可以通過(guò)協(xié)商、調(diào)解等方式，就證券合同糾紛進(jìn)行解決，達(dá)成和解協(xié)議。

2. 仲裁解決：雙方當(dāng)事人可以約定將證券合同糾紛提交仲裁機(jī)構(gòu)，由仲裁員進(jìn)行裁決，仲裁結(jié)果具有強(qiáng)制執(zhí)行力。

3. 訴訟解決：當(dāng)雙方無(wú)法通過(guò)協(xié)商或仲裁解決糾紛時(shí)，可以向人民法院起訴，進(jìn)行民事訴訟，最終由法院作出判決。

4. 其他方式：根據(jù)具體情況，當(dāng)事人還可以選擇采取其他方式處理證券合同糾紛，如調(diào)解、調(diào)查取證等。

在處理證券合同糾紛時(shí)，當(dāng)事人應(yīng)根據(jù)具體情況選擇最合適的解決方式，并根據(jù)法律規(guī)定和證據(jù)提供證明，以便維護(hù)自身權(quán)益。