集體土地上的商鋪在拆遷時主要有以下幾種補償。

第一種補償是在拆遷時拆遷戶應當給予搬遷準備工作的賠償，以及因拆遷、搬遷導致的停工損失費，搬遷和拆遷途中相關機器設備的修理、調(diào)試費用，相關物資在拆遷、包裝、運輸方面的費用，還有商家因搬遷可能對一些員工解聘的費用。

第二種補償是當商家得知店鋪即將被拆遷時，立即做好搬遷工作，那么國家會對此給予當事人一定的速遷費和鼓勵性質(zhì)的補償。當然，這方面的賠償費用應當要根據(jù)拆遷辦作出的拆遷補償協(xié)議得相關規(guī)定，確認拆遷是否符合法律規(guī)定，還有當事人是否能夠得到其他的賠償。

第三種補償是不屬于住宅而是用來經(jīng)營的房屋在拆遷時必涉及到停產(chǎn)停業(yè)損失費，而具體的補償應當由省、市級人民政府作出決定。

若拆遷的商鋪屬于非法建造的建筑，或者已經(jīng)超過法律規(guī)定的時間的暫時性建筑，是不會給予當事人相應補償?shù)?。拆遷補償?shù)姆椒ㄒ卜譃閮煞N，主要是貨幣形式的補償和將房屋產(chǎn)權調(diào)換。若要賠償貨幣，被拆遷的房屋在綜合考慮地理位置、用途以及面積等方面后，再參照房地產(chǎn)評估的標準價格確認賠償金額。而具體的賠償費用仍然是由省、自治區(qū)、直轄市人民政府來作出決定。

若當事人選擇將房屋的產(chǎn)權進行調(diào)換，那么相關部門應當請專業(yè)人士計算出原有房屋的補償和被調(diào)換房屋的市場價格，然后清算房屋產(chǎn)權調(diào)換的差價。商家假如是租用房屋進行經(jīng)營的，若商家和房屋得所有權人不再是租賃關系的，或者被拆遷房屋的當事人對房屋得所有權人實行安置的，則拆遷主體應當賠償被拆遷戶一定的補償費用。