租賃的廠房如果被確認(rèn)為違章建筑，需要采取以下措施：

1. 合作與溝通：與房東或租賃方進(jìn)行積極溝通，了解違章建筑的情況，爭(zhēng)取相互理解和支持。

2. 法律咨詢：咨詢專業(yè)律師或法律顧問(wèn)，了解法律相關(guān)規(guī)定，確定應(yīng)對(duì)違章建筑的合法措施。

3. 辦理相關(guān)手續(xù)：根據(jù)當(dāng)?shù)卣嚓P(guān)政策和程序，申請(qǐng)合法手續(xù)，例如建設(shè)工程規(guī)劃許可證、建設(shè)工程施工許可證等。

4. 尋求協(xié)助：聯(lián)系當(dāng)?shù)卣嚓P(guān)部門，如城市規(guī)劃部門、建設(shè)局等，向他們咨詢具體情況，并申請(qǐng)協(xié)助處理違章建筑問(wèn)題。

5. 自查整改：對(duì)于確定為違章建筑的部分，租戶可以主動(dòng)進(jìn)行整改。如果違章建筑部分無(wú)法整改，可以與房東商討尋找解決方案，例如雙方協(xié)商補(bǔ)償或重新找到合法的廠房。

6. 合法權(quán)益維護(hù)：如果上述步驟都無(wú)法解決問(wèn)題，為保護(hù)自身合法權(quán)益，可以依法向相應(yīng)政府部門進(jìn)行投訴或申訴，尋求更高層次的解決方案。

7. 尋求專業(yè)機(jī)構(gòu)支持：租戶可以尋求專業(yè)機(jī)構(gòu)或組織支持，例如租房中介、企業(yè)協(xié)會(huì)等，共同爭(zhēng)取解決問(wèn)題的合理方案。

總之，遇到租賃違章建筑的情況，租戶應(yīng)該保持積極溝通和合作，咨詢專業(yè)法律意見(jiàn)，并與相關(guān)政府部門進(jìn)行有效配合。在保護(hù)自身合法權(quán)益的同時(shí)，務(wù)必要遵守法律法規(guī)，積極參與整改工作，以及避免與房東或政府部門產(chǎn)生沖突。