拆遷企業(yè)如果認為征地拆遷工廠的行為侵犯了自身權(quán)益，可以采取以下措施起訴征地拆遷工廠：

1. 充分了解法律法規(guī)：拆遷企業(yè)需要熟悉國家有關(guān)征地拆遷的法律法規(guī)，例如《中華人民共和國土地管理法》、《城鄉(xiāng)規(guī)劃法》等，了解自身的權(quán)利和義務(wù)。

2. 收集證據(jù)材料：拆遷企業(yè)應(yīng)該收集證據(jù)材料來證明征地拆遷工廠的違法行為，例如收集相關(guān)的合同文件、土地評估報告、拆遷方案以及相關(guān)的通知函等，這些材料將成為起訴的法律依據(jù)。

3. 尋求法律援助：拆遷企業(yè)可以咨詢律師，尋求法律援助。律師可以根據(jù)現(xiàn)行法律法規(guī)，為拆遷企業(yè)提供專業(yè)的法律意見和建議，幫助拆遷企業(yè)制定起訴策略，提供法律代理。

4. 提起行政訴訟：拆遷企業(yè)可以根據(jù)自身權(quán)益，向相關(guān)行政部門提起行政訴訟，要求撤銷違法的征地拆遷工廠行為，并恢復拆遷前的狀態(tài)。要按照法定程序提交起訴狀和證據(jù)材料，并向法院交納相關(guān)訴訟費用。

5. 尋求媒體曝光：拆遷企業(yè)可以尋求媒體曝光，通過輿論監(jiān)督和輿論壓力，引起社會的關(guān)注和重視，推動相關(guān)政府部門采取必要措施解決問題。

6. 推動立法改革：如果拆遷企業(yè)認為現(xiàn)行的征地拆遷政策和法律法規(guī)存在問題，可以借助社會公眾力量，發(fā)起倡議推動立法改革，爭取拆遷企業(yè)的權(quán)益得到更好的保障。

在起訴征地拆遷工廠時，拆遷企業(yè)需要充分熟悉法律法規(guī)，尋求法律援助，持有充分的證據(jù)材料，通過行政訴訟和輿論壓力等手段，爭取保護自身的權(quán)益。同時，也要注重法律手續(xù)的執(zhí)行，遵循法院的判決決定，以維護法律的尊嚴和權(quán)威。