甲方回扣合同糾紛是指在商業(yè)交易中，乙方向甲方提供回扣或者返還差價的行為，違反了商業(yè)道德和法律規(guī)定，導致雙方產(chǎn)生了爭議。針對這種情況，處理甲方回扣合同糾紛的方法如下：

1.了解法律法規(guī)：作為甲方，首先要了解相關(guān)的法律法規(guī)，包括商業(yè)法律、合同法和反腐敗法等，明確乙方回扣行為的性質(zhì)和其對自身利益的影響。

2.收集證據(jù)：甲方需要收集相關(guān)的證據(jù)，包括合同、支付記錄、銀行轉(zhuǎn)賬憑證、郵件往來等，以便在糾紛處理中有力地證明乙方存在回扣違約行為。

3.協(xié)商解決：在糾紛發(fā)生后，甲方可以與乙方進行協(xié)商，通過雙方的溝通和談判，尋求解決糾紛的方法?？梢钥紤]修改合同、收回回扣金額或?qū)で笃渌问降难a償?shù)取?/p>

4.調(diào)解和仲裁：如果協(xié)商無果，甲方可以尋求第三方進行調(diào)解或者仲裁?？梢赃x擇相關(guān)政府機構(gòu)、仲裁機構(gòu)或獨立的律師事務(wù)所進行調(diào)解或者仲裁，并按照相關(guān)程序和要求提供證據(jù)和材料。

5.起訴訴訟：如果通過協(xié)商、調(diào)解和仲裁等方法無法解決糾紛，甲方可以選擇向法庭提起訴訟，要求法院依法判決糾紛的責任和賠償金額。

6.尋求法律援助：如果甲方在處理糾紛過程中遇到困難或者需要法律幫助，可以尋求法律援助，向?qū)I(yè)的律師咨詢，并獲取法律支持和指導。

在處理甲方回扣合同糾紛時，甲方應(yīng)當保持冷靜，理性地分析和處理問題，盡量通過合法手段解決糾紛，維護自身權(quán)益，遵守法律法規(guī)，樹立良好的商業(yè)信譽。