被告人在答辯合同糾紛時可以通過以下方式進行辯護：

1. 提交證據：被告人可以提交與合同糾紛相關的證據，如合同書、支付憑證、通信記錄等，以證明自己的合法權益和履行合同的意愿。

2. 澄清事實：被告人可以通過陳述事實真相來澄清自己的行為，并解釋與合同糾紛有關的具體情況，包括簽訂合同的合法性、合同內容和履行情況等。

3. 辯護理由：被告人可以根據合同條款及相關法律法規(guī)，提出辯護理由，如解釋合同約定的含義、免責條款的適用、不可抗力的存在等，以減輕或消除自己的法律責任。

4. 引用法律依據：被告人可以引用法律條文及相關裁判案例，證明自己的行為符合法律要求或合同約定，從而使法院對其判斷產生更有利的傾向。

5. 辯護詞撰寫：被告人應認真撰寫答辯詞，重點闡述自己的辯護觀點和理由，以及對原告主張的反駁和異議，同時表達自己的誠意與決心解決合同糾紛。

6. 法律援助：如果被告人無法自行辯護或缺乏法律知識，可以申請法律援助，由專業(yè)律師代表辯護，并提供專業(yè)意見和法律指導。

總之，被告人在答辯合同糾紛時需要充分了解案件事實和法律規(guī)定，提供充分的證據和合理的辯護理由，同時可以尋求法律援助以確保自身權益得到充分保障。