商鋪拆遷與工廠賠償屬于不同的領(lǐng)域，具體的賠償方式需要根據(jù)地方政府法律法規(guī)和雙方協(xié)商來決定。然而，在一些一般的情況下，商鋪拆遷應(yīng)該如何賠償工廠可以遵循以下原則和步驟：

1. 權(quán)益保護(hù)：政府拆遷商鋪應(yīng)與工廠進(jìn)行充分的溝通，確保工廠的合法權(quán)益得到最大程度的保護(hù)，不受損害。

2. 公平合理：賠償應(yīng)該以公平和合理的原則為基礎(chǔ)，考慮到工廠的資產(chǎn)價(jià)值、經(jīng)營收入、品牌形象、勞動力成本等因素，確定合理的賠償標(biāo)準(zhǔn)。

3. 賠償協(xié)商：政府和工廠應(yīng)該進(jìn)行協(xié)商，確定雙方都能接受的賠償方式和金額。可以參考類似地區(qū)的賠償慣例，也可以請專業(yè)的評估機(jī)構(gòu)評估賠償標(biāo)準(zhǔn)。

4. 臨時補(bǔ)償：在商鋪拆遷期間，政府應(yīng)及時進(jìn)行臨時補(bǔ)償，保證工廠正常運(yùn)營，避免造成不必要的經(jīng)濟(jì)損失。

5. 轉(zhuǎn)移安置：如果工廠需要搬遷到新的地方，政府應(yīng)提供合適的地塊或廠房，并承擔(dān)搬遷費(fèi)用、裝修費(fèi)用等，并確保新址的基礎(chǔ)設(shè)施和環(huán)境條件能夠滿足工廠的生產(chǎn)需求。

6. 成本補(bǔ)償：政府應(yīng)承擔(dān)因商鋪拆遷而造成的額外成本，例如搬遷費(fèi)用、勞動力成本增加或者產(chǎn)能的消耗等。

7. 經(jīng)濟(jì)補(bǔ)償：政府應(yīng)向工廠給予一定的經(jīng)濟(jì)補(bǔ)償，以彌補(bǔ)工廠由于商鋪拆遷而導(dǎo)致的經(jīng)濟(jì)損失。補(bǔ)償金額可以考慮工廠的價(jià)值和收益，也可以根據(jù)工廠的投資回報(bào)率來確定。

8. 特殊需求：如果工廠有特殊的需求，例如需要短期內(nèi)完成訂單或者繼續(xù)供應(yīng)商鋪的產(chǎn)品等，政府應(yīng)該根據(jù)實(shí)際情況提供相應(yīng)的支持和協(xié)助，保障工廠的正常運(yùn)營。

總之，商鋪拆遷應(yīng)該賠償工廠需要考慮到工廠的利益和合法權(quán)益，以公平、合理的原則為基礎(chǔ)進(jìn)行協(xié)商，并根據(jù)實(shí)際情況提供相應(yīng)的賠償和支持，確保工廠的正常運(yùn)營和穩(wěn)定發(fā)展。