南京拆遷廠房賠償是根據相關法律法規(guī)以及當地政府部門的規(guī)定來確定的。具體的賠償計算方法如下：

1.評估房屋價值：首先，需要進行房屋評估，評估機構會根據房屋的面積、地段位置、建筑質量等因素來確定房屋的市場價值。

2. 補償方式：按照國家相關政策的規(guī)定，工業(yè)企業(yè)拆遷可以選擇全款補償、自愿選購新房及貨幣補償、金租等方式進行補償。

3. 功能補償：除了根據房屋本身價值進行補償以外，根據當地政府的要求，還會根據廠房的功能、用途進行補償。比如，與產業(yè)轉型、城市規(guī)劃等相關的業(yè)務發(fā)展補償，根據拆遷后用地的新用途、拆遷后的企業(yè)在新地段的經濟利益補償等。

4.生活補償：對于被拆遷的企業(yè)員工和居民，根據相關法律法規(guī)，還需要進行合理的生活和安置補償，如失地農民、轉業(yè)安置失業(yè)人員、被拆遷的員工等。

總之，南京拆遷廠房賠償是按照評估房屋價值、補償方式、功能補償和生活補償等因素綜合考慮來確定的。不同的地區(qū)和情況下，具體的賠償標準和計算方法可能會有所差異。因此，拆遷廠房賠償的具體金額需要根據當地政府的政策和相關法律法規(guī)來確定。