合同糾紛的被告人應(yīng)該采取以下措施來處理：

1.咨詢法律專業(yè)人士：被告人應(yīng)該盡快尋求法律專業(yè)人士的意見和建議，以了解自己的法律權(quán)益和責(zé)任，以及可能的解決方案。

2.審查合同文件：被告人需要仔細審查與合同相關(guān)的文件和證據(jù)，包括合同條款、交流記錄、支付憑證等，以了解爭議的核心和每個當事人的責(zé)任。

3.準備答辯材料：被告人應(yīng)該準備詳細的答辯材料，包括相關(guān)證據(jù)、合同解釋和相關(guān)法律法規(guī)的引用，以支持自己的觀點和主張。

4.參與調(diào)解或談判：被告人可以積極主動地與原告或其代理人聯(lián)系，商討解決糾紛的可能性。這可能包括參與調(diào)解過程、協(xié)商談判或?qū)で笃渌娲鸂幾h解決方式，如仲裁或調(diào)解。

5.合作法院的調(diào)查和程序：如果案件進入訴訟程序，被告人應(yīng)該積極配合法院的調(diào)查和程序，提供相關(guān)證據(jù)和文件，并按照法院的要求提供相關(guān)的答辯文件。

6.尋求法律援助：如果被告人無法負擔(dān)法律費用或缺乏法律知識，可以尋求法律援助，例如申請法院指定辯護人或咨詢免費法律援助機構(gòu)。

7.遵循判決或仲裁裁決：如果法院或仲裁機構(gòu)作出了裁決或判決，被告人應(yīng)該遵循和執(zhí)行，并按照判決或裁決的要求履行自己的義務(wù)。

總之，被告人應(yīng)該盡力合法合理地處理合同糾紛，通過與對方的合作和妥協(xié)，或依靠法律程序來維護自己的權(quán)益。