在合同糾紛中涉及到專利侵權(quán)的情況下，可以采取以下步驟進行處理：

1. 尋求律師協(xié)助：專利侵權(quán)案件通常需要專業(yè)的法律知識和經(jīng)驗來處理，因此尋求一位專業(yè)的專利侵權(quán)律師協(xié)助你，能夠在法律程序中為你提供支持和指導。

2. 收集證據(jù)：在授權(quán)的范圍內(nèi)，收集和保留相關(guān)證據(jù)，以證明對方的侵權(quán)行為。這可能包括專利證書、文件、照片、電子郵件和其他相關(guān)信息。

3. 發(fā)出警告信：律師可以起草一封警告信，向侵權(quán)人發(fā)出合法通知，明確指出其侵權(quán)行為，并要求其停止侵權(quán)活動，并在一定期限內(nèi)支付賠償。

4. 調(diào)解或和解：為避免進一步的法律爭議，當事雙方可以通過調(diào)解或和解來解決爭議。調(diào)解可以通過法院、調(diào)解員或?qū)I(yè)的調(diào)解機構(gòu)進行，協(xié)商達成雙方可接受的解決方案。

5. 提起訴訟：如果侵權(quán)方不同意解決爭議，你可以選擇向法院提起訴訟。在法庭上，你需要提供證據(jù)，證明對方侵犯了你的專利權(quán)，并請求法院判決對方賠償你的損失。

6. 追索賠償：如果法院判決侵權(quán)人有罪，你可以要求法院判決對方支付賠償金，以補償你的經(jīng)濟損失和其他損害。賠償金額將根據(jù)侵權(quán)行為的嚴重性、損失的程度、商業(yè)價值等因素確定。

需要注意的是，專利侵權(quán)案件可能會涉及復雜的法律程序和專業(yè)知識，因此建議在處理過程中充分咨詢專業(yè)律師并遵守法律規(guī)定的步驟和程序。