審核改造工程合同糾紛需要提取相關合同文件和證據，進行仔細、全面的分析和比對。具體步驟如下：

1. 閱讀合同：仔細閱讀改造工程合同的所有條款和細則，特別關注工程范圍、工期、價格、質量標準、支付方式等重要條款。

2. 了解相關法律法規(guī)：熟悉適用的法律法規(guī)，如建筑法、招投標法等，明確變更合同的程序和規(guī)定。

3. 收集證據：收集與合同糾紛相關的證據，包括書面記錄、證書、支付憑證、照片等，確保證據齊全可靠。

4. 考察工程現場：實地考察工程現場，了解工程進展情況、質量狀況以及可能存在的問題，并與各方溝通交流。

5. 聆聽各方訴求：與雙方或多方當事人進行溝通，了解各方對合同的理解和訴求，查明合同履行過程中可能存在的分歧或爭議點。

6. 可行性分析：基于收集到的證據和各方訴求，進行合同糾紛的可行性分析，評估各方的權利和責任。

7. 調解或仲裁：如果可能，可以嘗試通過調解或仲裁解決合同糾紛。召集各方進行協(xié)商談判，尋求雙贏的解決方案。

8. 仲裁裁決或訴訟：如果調解或仲裁無法解決爭議，可以考慮將糾紛提交至法院解決，根據法律程序進行相關訴訟。

最后，審核改造工程合同糾紛時需要保持公正、客觀的立場，依法依規(guī)進行調查和裁決，確保公平解決合同糾紛。