商鋪轉讓合同糾紛處理需要根據具體情況進行分析和解決，以下是一些建議：

首先，雙方可以嘗試通過友好協(xié)商解決糾紛。雙方可以相互交換意見，通過溝通來解決分歧。如果合同中存在模糊或不完善的條款，可以商討修改合同來達成一致。

如果協(xié)商無果，雙方可以尋求專業(yè)咨詢或仲裁。咨詢專業(yè)律師或相關機構可以提供法律意見，協(xié)助解決糾紛。如果合同中有仲裁條款，可以依據條款進行仲裁解決。

如果仲裁仍然不能解決問題，雙方可以考慮提起訴訟。在訴訟過程中，需要準備相關證據、合同等文件，通過法院判決來解決糾紛。法院會根據法律和證據來判決案件。

無論選擇何種方式解決糾紛，都需要注意保護自身權益。在糾紛處理過程中，保持冷靜，理性對待，同時積極尋求合法的解決辦法。如有需要，可以咨詢專業(yè)人士的意見，以確保糾紛得到公正處理。