被告在合同糾紛案件中進行上訴時，應(yīng)該采取以下措施進行應(yīng)訴：

1. 審查案件材料：仔細研究原審判決書、上訴狀及其他相關(guān)文件，了解案件背景、爭議點和相關(guān)法律問題。

2. 編寫答辯狀：根據(jù)案件具體情況，通過律師或自己編寫答辯狀，明確陳述被告的觀點、事實和證據(jù)。答辯狀應(yīng)包括被告的身份、訴訟請求、法律依據(jù)以及相關(guān)證據(jù)和理由。

3. 收集證據(jù)：根據(jù)爭議點，積極收集相關(guān)證據(jù)，包括合同文件、交易記錄、郵件通信等，以證明被告的合法權(quán)益和合同履行情況。

4. 委托律師代理：選擇一位有經(jīng)驗的律師代理自己的案件，并與律師密切合作，提供信息和協(xié)助律師的調(diào)查和準備。

5. 出庭辯護：按照法院的通知和規(guī)定，出庭參加上訴，并進行專業(yè)辯護，闡明事實和法律依據(jù)。要根據(jù)具體情況，靈活運用法律理論和判例，為自己爭取合法權(quán)益。

總之，在被告應(yīng)訴過程中，需要認真準備，積極配合律師或自行行動，并遵守法院的規(guī)定和程序，以確保自己的權(quán)益得到充分保護。