商鋪第二層拆遷的賠償一般需要根據(jù)當(dāng)?shù)氐牟疬w政策進(jìn)行協(xié)商確定。通常情況下，拆遷賠償會包括以下幾個方面：

1.房屋補(bǔ)償費(fèi)用：根據(jù)商鋪的實(shí)際面積、使用年限、市場價值等因素進(jìn)行評估，并按照當(dāng)?shù)叵嚓P(guān)標(biāo)準(zhǔn)進(jìn)行賠償。

2.搬遷費(fèi)用：包括拆遷補(bǔ)償款的一部分用于支付商鋪搬遷所需的費(fèi)用，如辦理搬遷手續(xù)費(fèi)、運(yùn)輸費(fèi)、裝修費(fèi)等。

3.補(bǔ)償工程款：如果商鋪拆遷對業(yè)主造成了一定損失，如因搬遷導(dǎo)致工作停滯、收入減少等，可以在協(xié)商中納入補(bǔ)償范圍。

4.過渡期租金：如果商鋪第二層拆遷后需要一定時間進(jìn)行新場所的裝修和重新開業(yè)，可以與拆遷方協(xié)商確定過渡期租金的支付方式和額度。

需要注意的是，拆遷賠償金額的確定需要根據(jù)當(dāng)?shù)卣嚓P(guān)的拆遷政策進(jìn)行協(xié)商確定，因此建議在進(jìn)行商鋪拆遷之前咨詢當(dāng)?shù)叵嚓P(guān)部門或?qū)I(yè)律師，以確保自身的權(quán)益能夠得到合理的維護(hù)和賠償。