商洛違建超層的處罰應根據(jù)相關(guān)法律法規(guī)和政府規(guī)定進行。首先，相關(guān)部門可以要求拆除違建，恢復原貌。其次，可以對違法建設者進行罰款，根據(jù)違建面積和嚴重程度而定，以起到懲戒作用。同時，可以暫?；蛉∠湎嚓P(guān)行業(yè)的經(jīng)營許可證、資質(zhì)證書，限制其從事相關(guān)行業(yè)。另外，對于承辦違建工程的相關(guān)責任人，可以根據(jù)法律規(guī)定追究其法律責任，甚至采取刑事責任追究。此外，可以公開曝光違建者的違法行為，以起到示范作用和警示效果。綜上所述，商洛違建超層應該根據(jù)相關(guān)法律法規(guī)對其進行嚴厲的處罰，以確保城市建設的規(guī)范有序。