公司清算是指公司依法解散和注銷，結(jié)束公司的全部經(jīng)營活動(dòng)，依法分配剩余財(cái)產(chǎn)、償還債務(wù)，并辦理注銷手續(xù)的過程。在公司清算過程中，如果發(fā)生合同糾紛，處理方式如下：

1.合同履行：如果合同糾紛的合同尚未到期，且公司清算前有足夠的能力履行合同，應(yīng)該繼續(xù)按合同約定履行。

2.合同解除：對(duì)于已發(fā)生且影響清算的合同糾紛，清算決策人可以與對(duì)方協(xié)商解除合同，達(dá)成一致意見后進(jìn)行解除手續(xù)，解除后按照合同約定進(jìn)行賠償、賦予權(quán)利或承擔(dān)義務(wù)。

3.債權(quán)債務(wù)轉(zhuǎn)讓：如果公司清算無力履行合同，清算決策人可以將公司的債權(quán)債務(wù)轉(zhuǎn)讓給其他方，以便完成清算工作。轉(zhuǎn)讓后，新承接債權(quán)債務(wù)的方應(yīng)繼續(xù)履行合同，并承擔(dān)相應(yīng)的責(zé)任。

4.申請(qǐng)仲裁或訴訟：如果合同糾紛無法通過協(xié)商解決，清算決策人可以提起仲裁或訴訟。在仲裁或訴訟程序中，清算決策人代表清算公司進(jìn)行法律訴訟，維護(hù)公司的合法權(quán)益。

5.清算分配：在公司清算完成后，清算人員根據(jù)法律規(guī)定對(duì)公司的財(cái)產(chǎn)進(jìn)行分配。如果清算決策人認(rèn)為某些合同糾紛應(yīng)納入清算分配范圍，則需將合同糾紛向清算人員申報(bào)，并提供相關(guān)證據(jù)和材料，清算人員根據(jù)法律規(guī)定對(duì)合同糾紛進(jìn)行處理。

需要注意的是，在公司清算過程中，應(yīng)當(dāng)嚴(yán)格依照法律法規(guī)進(jìn)行操作。如果合同糾紛涉及重大金額或復(fù)雜情況，建議尋求專業(yè)律師的法律意見，并與相關(guān)方展開合理有效的協(xié)商，以便盡可能地保護(hù)公司的利益。