認定工程合同糾紛案例涉及多方面的考慮和評估，需要綜合考慮以下幾個方面：

1. 合同條款：首先要對合同條款進行分析評估，包括工程范圍、價格、質(zhì)量、進度、支付方式等條款。如果發(fā)現(xiàn)合同條款存在爭議或者模糊不清，可能會導(dǎo)致糾紛的發(fā)生。

2. 證據(jù)收集：對于發(fā)生糾紛的案例，需要收集相關(guān)的證據(jù)材料，包括合同、付款憑證、技術(shù)檔案、驗收報告等，以確保有足夠的證據(jù)支持糾紛的認定。

3. 工程過程：對工程實施過程進行調(diào)查，了解實際執(zhí)行情況是否符合合同要求，包括工程質(zhì)量、進度、材料使用等方面。如果發(fā)現(xiàn)存在工程質(zhì)量問題或者違反合同約定的情況，可能會導(dǎo)致糾紛產(chǎn)生。

4. 行為分析：對參與工程實施的各方當事人的行為進行分析，包括業(yè)主、承包商、監(jiān)理等各方的責(zé)任和義務(wù)履行情況。如果發(fā)現(xiàn)某一方存在違約行為或者不當行為，可能會成為糾紛的原因。

5. 專業(yè)評估：對工程技術(shù)和質(zhì)量問題進行專業(yè)評估，通過技術(shù)專家的鑒定和意見書等證據(jù)，確定工程實施是否達到行業(yè)標準和合同要求。如果專業(yè)評估發(fā)現(xiàn)存在質(zhì)量問題，可能會導(dǎo)致工程合同糾紛。

綜上所述，認定工程合同糾紛案例需要綜合考慮合同條款、證據(jù)收集、工程過程、行為分析和專業(yè)評估等因素，通過對以上方面的認真調(diào)查和評估，可以對工程合同糾紛案例進行認定和處理。