當公司面臨合同糾紛并決定提起訴訟時，一般可以按照以下步驟進行處理：

1. 收集證據(jù)：首先，公司應詳細收集與合同糾紛相關的所有證據(jù)，包括合同文件、交易記錄、電子郵件、通信記錄、支付憑證等。這些證據(jù)將對公司在法庭上證明其主張的合法性至關重要。

2. 尋求法律意見：公司可以請律師對合同糾紛進行評估，并提供法律意見。律師將幫助公司確定是否有合法理由提起訴訟，并提供法律建議。

3. 起訴程序：如果公司決定提起訴訟，律師將協(xié)助公司準備并提交訴訟文件，包括起訴狀、辯詞、證據(jù)清單等。公司應確保按照法定期限和程序要求提交訴訟文件，以確保訴訟程序有效進行。

4. 法庭程序：一旦訴訟程序啟動，公司和被告將進入法庭程序。公司應積極參與庭前調(diào)解、庭前會議和庭審等程序，并根據(jù)律師的建議進行辯護和提供證據(jù)。

5. 和解或裁決：在訴訟過程中，當事雙方可以通過和解方式解決爭議，或者接受法院的裁決。公司應根據(jù)實際情況和律師的建議，權衡和解或繼續(xù)訴訟的利弊，并作出明智的決策。

6. 執(zhí)行判決：如果公司獲得有利的判決，但被告方不履行判決，公司還需要采取相應的執(zhí)行措施，例如申請財產(chǎn)保全、強制執(zhí)行等，以確保公司的權益得到有效保護。

需要注意的是，合同糾紛的處理需要依賴律師等專業(yè)人士的支持和指導。公司在面臨合同糾紛時應積極尋求專業(yè)意見，并確保遵守相關法律法規(guī)的規(guī)定，以確保合法權益的得到有效維護。