土地流轉(zhuǎn)合同糾紛是指在土地流轉(zhuǎn)過程中，因合同條款解釋不明、履約義務(wù)不履行或者違約行為等原因，導(dǎo)致合同雙方發(fā)生爭議的情況。以下是處理土地流轉(zhuǎn)合同糾紛的一般步驟和方法：

1. 協(xié)商解決：首先，當(dāng)雙方發(fā)現(xiàn)合同發(fā)生爭議時，應(yīng)該及時進(jìn)行協(xié)商，以達(dá)成一致意見并解決糾紛。協(xié)商解決的優(yōu)勢是節(jié)省時間和費(fèi)用，同時能夠保持雙方關(guān)系的和諧。

2. 調(diào)解解決：雙方協(xié)商未果，可尋求相關(guān)部門或?qū)I(yè)機(jī)構(gòu)進(jìn)行調(diào)解。調(diào)解員會起到中立的角色，促使雙方就爭議事項進(jìn)行對話、磋商，最終達(dá)成和解協(xié)議。

3. 訴訟解決：如果協(xié)商和調(diào)解都無法解決爭議，當(dāng)事人可以向法院提起訴訟，請求法院根據(jù)合同約定和相關(guān)法律判定糾紛的權(quán)益歸屬。法院將對案件進(jìn)行審理，并根據(jù)證據(jù)和法律規(guī)定作出判決。雙方應(yīng)該按照法院的判決結(jié)果履行義務(wù)。

4. 仲裁解決：另外一種解決糾紛的方式是通過仲裁。仲裁在處理爭議上有著較高的效率和靈活性，當(dāng)事人可以選擇某個仲裁機(jī)構(gòu)或指定仲裁員進(jìn)行爭議的裁決。

在處理土地流轉(zhuǎn)合同糾紛時，當(dāng)事人應(yīng)保留所有相關(guān)的證據(jù)，包括合同、支付記錄、通信記錄等，并盡量尋求專業(yè)的法律意見。同時，合同的擬定可以事先明確合同條款以避免糾紛的發(fā)生。最重要的是，雙方應(yīng)保持對話和溝通的渠道，盡量避免糾紛的擴(kuò)大和惡化。

總之，處理土地流轉(zhuǎn)合同糾紛需要雙方共同努力，首先通過協(xié)商和調(diào)解解決，如果無法達(dá)成一致，可以尋求訴訟或仲裁的方式進(jìn)行糾紛解決。