合同糾紛受理費是指受理法院根據(jù)法律規(guī)定向當(dāng)事人收取的費用。根據(jù)《關(guān)于收取合同糾紛案件受理費的規(guī)定》（以下簡稱《規(guī)定》），合同糾紛受理費的收取標準為合同標的額的比例，具體比例根據(jù)合同標的額的大小而有所不同。

首先，要明確的是，合同糾紛受理費是屬于司法收入的一種。根據(jù)中國的財政制度，司法收入大多數(shù)是可支付性質(zhì)的非稅收入，主要來源包括裁判費、立案費、調(diào)解費、執(zhí)行費等。合同糾紛受理費作為司法收入的一部分，一般會準時入賬，并納入法院的預(yù)算管理。

具體的入賬流程一般如下：首先，當(dāng)事人在向法院提起合同糾紛訴訟時需要繳納受理費。法院會設(shè)立特定的窗口或柜臺，接收當(dāng)事人繳納的受理費。一般而言，當(dāng)事人可以通過現(xiàn)金、刷卡等方式繳納受理費。然后，法院工作人員會向當(dāng)事人開具相應(yīng)的繳費收據(jù)，確認受理費的繳納。最后，收到受理費后，法院會將受理費入賬，納入法院的賬戶中。

這樣，合同糾紛受理費就完成了入賬的流程。法院可以根據(jù)需要使用這些收入用于支付法官工資、案件調(diào)查費、法院運行費用等。

總結(jié)起來，合同糾紛受理費的入賬流程是當(dāng)事人繳納受理費后，法院收到受理費并開具繳費收據(jù)，然后將受理費入賬納入法院的賬戶中。這樣，法院可以將收入用于支付相關(guān)的費用和支出。

另外，需要指出的是，合同糾紛受理費的具體收取標準和入賬情況可能會因地區(qū)和相關(guān)政策的差異而有所不同。因此，在具體操作過程中，需要根據(jù)當(dāng)?shù)氐囊?guī)定和政策來進行操作和處理。