小區(qū)幾十年的違章建筑如何補(bǔ)償是一個較為復(fù)雜的問題，需根據(jù)具體情況進(jìn)行判斷。一般來說，如果違章建筑存在多年且未被相關(guān)部門發(fā)現(xiàn)，可能會遇到以下情況。

首先，如果該違章建筑已經(jīng)存在多年，且符合相關(guān)法律和規(guī)定，可能可以通過合法化手續(xù)來進(jìn)行補(bǔ)償。這意味著業(yè)主需要按照法定程序，向相關(guān)部門提交申請，經(jīng)過審批后納入合法建筑范圍，并支付相應(yīng)的稅費(fèi)和費(fèi)用。

其次，如果違章建筑存在多年且超出了法律法規(guī)規(guī)定的界限，可能需要進(jìn)行拆除或重新規(guī)劃。在這種情況下，業(yè)主可能需要與相關(guān)部門或開發(fā)商進(jìn)行談判，以達(dá)成適當(dāng)?shù)难a(bǔ)償協(xié)議。補(bǔ)償?shù)男问娇赡馨ń?jīng)濟(jì)補(bǔ)償、房屋置換或提供其他相應(yīng)的資源等。關(guān)鍵是要與相關(guān)方進(jìn)行良好的溝通和協(xié)商，以達(dá)成雙方都能接受的補(bǔ)償方案。

最后，補(bǔ)償?shù)木唧w金額將根據(jù)違章建筑的情況、當(dāng)?shù)卣吆头煞ㄒ?guī)而定。一般來說，補(bǔ)償金額應(yīng)該根據(jù)違章建筑的價值、影響范圍以及對業(yè)主的實(shí)際損失等因素進(jìn)行評估。此外，要考慮到當(dāng)?shù)胤煞ㄒ?guī)的規(guī)定，不同地區(qū)的補(bǔ)償政策可能會有所不同。

總之，對于存在多年的違章建筑，需要根據(jù)具體情況進(jìn)行判斷和處理，與相關(guān)部門或開發(fā)商進(jìn)行溝通和協(xié)商，以達(dá)成適當(dāng)?shù)难a(bǔ)償方案。同時，應(yīng)了解當(dāng)?shù)氐姆煞ㄒ?guī)和政策，以確保補(bǔ)償過程的合法性和公正性。