解決工程設(shè)計合同糾紛的方法可以分為以下幾種：

1. 協(xié)商解決：雙方可以通過協(xié)商尋求解決方案，比如重新商定設(shè)計方案、調(diào)整合同條款，或者支付補(bǔ)償款等。協(xié)商解決可以在雙方自愿的情況下達(dá)成，避免長時間的法律糾紛。

2. 調(diào)解解決：雙方可以選擇請第三方中立的調(diào)解人介入，協(xié)助雙方溝通并尋求解決方案。調(diào)解通常比訴訟更快捷、簡潔，可以保持雙方的關(guān)系，減少彼此的損失。

3. 仲裁解決：通過仲裁委員會或者專門的仲裁機(jī)構(gòu)進(jìn)行仲裁，由仲裁庭作出相應(yīng)判決。仲裁過程相對于訴訟更加簡化，也更加迅速，決定一般具有強(qiáng)制執(zhí)行力。

4. 訴訟解決：如果協(xié)商、調(diào)解等方式無法解決合同糾紛，雙方可以選擇提起訴訟，將糾紛提交給法院進(jìn)行審理。法院會依法進(jìn)行裁決，并對未履行合同義務(wù)的一方進(jìn)行相應(yīng)的賠償和處罰。

在選擇解決方式時，應(yīng)根據(jù)實際情況綜合考慮各種因素，如時間、成本、風(fēng)險、雙方關(guān)系等，選擇最適合的解決方式。同時，也可以尋求法律專業(yè)人士的幫助，進(jìn)行法律咨詢和指導(dǎo)，以確保自身權(quán)益得到有效保護(hù)。