商家合同糾紛的索賠方式可以通過以下幾點來進行操作：

首先，合同糾紛的索賠過程應(yīng)該是基于合同的條款和約定。當出現(xiàn)糾紛時，可以首先仔細閱讀合同條款，確定自己的權(quán)益和責(zé)任。如果發(fā)現(xiàn)對方違反了合同的內(nèi)容，可以以此為依據(jù)進行索賠。

其次，可以采取協(xié)商的方式解決糾紛?？梢耘c對方商家進行詳細的溝通，說明自己的權(quán)益受到了侵害，并提出索賠的要求。協(xié)商過程中，雙方可以就補償金額、責(zé)任承擔等問題進行討論，尋找雙方都可以接受的解決方案。

如果協(xié)商無效，可以選擇申請仲裁或者起訴。根據(jù)合同中的爭議解決方式，可以選擇向相關(guān)部門申請仲裁，或者直接向法院起訴。在申請仲裁或者起訴的過程中，將需要提供相關(guān)證據(jù)，以證明自己的損失。

不過，無論是協(xié)商還是仲裁、訴訟，都需要充分準備證據(jù)?？梢员Ａ襞c合同有關(guān)的文件、照片、聊天記錄等，以便提供給仲裁機構(gòu)或者法院作為證明。此外，也可以請律師提供相關(guān)法律意見和協(xié)助。

總的來說，商家合同糾紛的索賠需要明確合同條款，并根據(jù)具體情況選擇合適的解決方式，以維護自己的合法權(quán)益。