處理合伙虧損合同糾紛的方法主要包括以下幾點：

1. 查閱合伙協(xié)議：首先要查閱合伙協(xié)議，了解雙方在合同中約定的權益分配、責任及義務等問題，以確定合伙企業(yè)的運作準則和解決糾紛的方法。

2. 協(xié)商解決：雙方可以通過協(xié)商來尋求解決方案。雙方應坐下來討論問題，并充分表達各自的意見和訴求。通過有效的溝通和妥協(xié)，可以達成雙方都能接受的解決方案。

3. 仲裁或調解：如果協(xié)商無法解決爭議，可以尋求第三方的仲裁或調解。找一位公正、熟悉相關法律的仲裁員或調解員，聽取雙方的陳述，評估爭議的事實和證據，并提出公正的解決方案。遵守仲裁或調解的結果，達成和解。

4. 起訴法院：如果以上方法無法解決糾紛，被損害的一方可以提起訴訟。將爭議提交給法院裁決，并搜集相關證據，以證明自己的權益受到侵害。法院會根據合同及相關法律判決爭議。

總體而言，處理合伙虧損合同糾紛需要根據具體情況采取相應的處理方法，協(xié)商解決是首選，通過仲裁或訴訟是較為常見的解決方案。在這一過程中，保持冷靜、理性和合法為原則，以達成公平公正的解決。