工程勘察合同糾紛處理的一般程序如下：

1. 協(xié)商解決：雙方當事人可通過友好協(xié)商解決合同糾紛。他們可就問題進行溝通，明確各自的訴求和利益，并尋求互利互惠的解決方案。

2. 調解解決：若協(xié)商未果，雙方可選擇由獨立的第三方進行調解。調解員會幫助雙方達成共識，并制定具體的解決方案。調解一般快速高效，而且能保留雙方關系。

3. 仲裁解決：如果調解不成功，雙方可以選擇仲裁方式解決合同糾紛。他們可向仲裁機構申請仲裁，由仲裁員聽取雙方的陳述和證據(jù)，并作出裁決。仲裁是一種具有法律效力的解決糾紛的方法。

4. 訴訟解決：如果仲裁無法解決爭議，當事人可向法院提起訴訟，依法進行審理。法院會根據(jù)事實和法律規(guī)定，做出最終裁決。

無論采取哪種方式解決糾紛，關鍵是雙方應盡量保持溝通和合作，積極尋求解決方案。此外，合同的明確性和有效性也對糾紛解決起重要作用。建議當事人在簽訂合同時明確約定各項權責，合理分擔風險，以減少合同糾紛的發(fā)生。