監(jiān)理在管理施工合同糾紛時，可以采取以下措施：

1.審查合同文件：監(jiān)理應仔細審查施工合同的內(nèi)容，包括合同條款、工程量清單、設計文件等，了解雙方權利義務，以便在糾紛發(fā)生時可以有依據(jù)。

2.認真履行職責：監(jiān)理應按照合同的約定和法律法規(guī)要求，對施工過程進行全程跟蹤和監(jiān)督，及時發(fā)現(xiàn)和處理可能引發(fā)糾紛的問題，以避免糾紛的發(fā)生和擴大。

3.協(xié)調(diào)雙方：監(jiān)理應及時了解雙方的意見和訴求，通過協(xié)調(diào)調(diào)解等方式，盡可能解決糾紛，以避免影響工程進度和質(zhì)量。

4.提供意見和建議：監(jiān)理應根據(jù)自身專業(yè)知識和經(jīng)驗，對糾紛進行評估和分析，并為業(yè)主和承包商提供相關的意見和建議，幫助雙方解決糾紛。

5.協(xié)助解決糾紛：監(jiān)理可以協(xié)助雙方進行談判、調(diào)解或仲裁，或提供相應的證據(jù)和文件，幫助雙方解決糾紛，維護合同的有效性和權益的合法性。

6.記錄和備案：監(jiān)理應及時記錄施工過程中的工作變更、問題和糾紛情況，并保存相關的證據(jù)和文件，以備糾紛解決時使用。

總而言之，監(jiān)理在管理施工合同糾紛時，應秉持公正、客觀、合法的原則，盡力協(xié)調(diào)雙方關系，爭取早期解決糾紛，確保工程的順利進行。