上海違章廠房的認(rèn)定主要依據(jù)《中華人民共和國城市規(guī)劃法》以及《上海市城市規(guī)劃建設(shè)管理條例》等法律法規(guī)，認(rèn)定違建主要從以下幾個方面進(jìn)行：

1. 規(guī)劃手續(xù)是否齊全：對于廠房是否進(jìn)行了規(guī)劃審批和規(guī)劃許可手續(xù)的認(rèn)定，是否符合規(guī)劃用途、建筑規(guī)模、用地面積等要求。

2. 建設(shè)行為是否合法：對于廠房是否按照建設(shè)工程法律法規(guī)規(guī)定的程序進(jìn)行建設(shè)，是否取得相關(guān)建設(shè)許可證、施工許可證等手續(xù)的認(rèn)定。

3. 建設(shè)是否符合用途及規(guī)模：對于廠房是否符合使用規(guī)模、使用性質(zhì)等要求，例如是否改變了用途，是否超過了原規(guī)劃的建筑面積等進(jìn)行認(rèn)定。

4. 違章建筑的確認(rèn)：對于廠房是否存在違反規(guī)劃、建設(shè)等法律法規(guī)的情況，例如未經(jīng)審批擅自改變用途、違規(guī)建設(shè)等進(jìn)行認(rèn)定。

認(rèn)定違建涉及多方面的信息和規(guī)章制度，需要相關(guān)法律法規(guī)的支持，具體的認(rèn)定需要由相關(guān)部門進(jìn)行檢查和定性。