在建工合同糾紛的二審中，雙方可以通過以下方式進(jìn)行辯論：

1. 辯論事實真?zhèn)危弘p方可以就合同履行過程中的主要事實爭議展開辯論，針對對方陳述的事實提出質(zhì)疑，并提供相關(guān)證據(jù)或證人來支持自己的觀點。

2. 辯論合同解釋：雙方可以就合同的具體條款進(jìn)行解釋辯論，比較不同的解釋方式，指出自己的解釋更符合合同的意圖和雙方的意愿。

3. 辯論違約責(zé)任：如果一方認(rèn)為對方存在違約行為，可以就違約責(zé)任進(jìn)行辯論，說明對方的違約行為給自己造成的損失，并提出補償?shù)囊蟆?/p>

4. 辯論證據(jù)合法性：雙方可以就對方提供的證據(jù)材料進(jìn)行辯論，質(zhì)疑其合法性和真實性，盡可能排除或減弱對方提供的證據(jù)的效力。

在辯論過程中，雙方應(yīng)嚴(yán)格遵守法庭規(guī)則和程序，尊重對方的權(quán)益，全面綜合考慮事實和法律依據(jù)，充分行使自己的辯論權(quán)利，爭取獲得有利于自己的判決結(jié)果。