企業(yè)合同的撤銷合同糾紛可以通過以下幾種方式進行。首先，雙方可以協(xié)商解決糾紛，通過商討、妥協(xié)等方式，達成一致意見并簽署解除合同的協(xié)議。其次，可以選擇爭議解決機構(gòu)進行調(diào)解、仲裁或訴訟，根據(jù)合同中的爭議解決條款選擇適當?shù)姆绞浇鉀Q糾紛。第三，如果發(fā)現(xiàn)對方違反了合同的規(guī)定，可以通過法律程序追究其責任，包括索賠、追償?shù)确绞絹斫鉀Q糾紛。無論使用何種方式，企業(yè)在解決合同糾紛時應注重保護自身合法權(quán)益，盡可能減少損失，并確保法律程序的合法性和公正性。