工程施工合同糾紛的起訴程序如下：

1. 起訴前準(zhǔn)備階段：在決定起訴之前，需要收集與合同糾紛相關(guān)的證據(jù)，包括合同、付款記錄、施工過程中的通信記錄、施工質(zhì)量檢測(cè)報(bào)告等。這些證據(jù)將對(duì)日后的訴訟起到關(guān)鍵作用。

2. 起訴階段：起訴時(shí)，需要向人民法院提出民事訴訟申請(qǐng)書。該申請(qǐng)書必須包括起訴目的、事實(shí)與理由、所需的證據(jù)以及請(qǐng)求法院判決的內(nèi)容等。此外，原告還需支付訴訟費(fèi)用。

3. 立案階段：法院受理申請(qǐng)后，會(huì)對(duì)申請(qǐng)書進(jìn)行審查，并決定是否受理該案件。如果受理，法院將依法立案，并發(fā)出傳票給被告，通知其出庭參加訴訟。

4. 舉證階段：在庭審過程中，原告需要提供充分的證據(jù)支持自己的主張。被告也會(huì)有機(jī)會(huì)提供證據(jù)進(jìn)行辯護(hù)。雙方可以進(jìn)行證人、鑒定及勘驗(yàn)等證據(jù)調(diào)查活動(dòng)。

5. 判決階段：庭審結(jié)束后，法院將進(jìn)行案件審理，并最終作出判決。判決是法院對(duì)案件爭議進(jìn)行裁決的結(jié)果，需要雙方遵守。

6. 執(zhí)行階段：如果被告不服判決結(jié)果，可以提出上訴。如果判決生效且被告未履行判決，原告可以申請(qǐng)強(qiáng)制執(zhí)行，將判決結(jié)果落實(shí)到實(shí)際行動(dòng)中。

需要注意的是，工程施工合同糾紛的起訴程序可能因不同地區(qū)的法律法規(guī)而有所不同。在起訴之前，建議咨詢專業(yè)律師，以確保程序的正確性和合法性。