合同糾紛案件在法院執(zhí)行時，主要遵循以下程序：

1. 受理：當一方向法院提起合同糾紛案件的訴訟時，法院會在收到起訴材料后進行受理。法院會驗明起訴書的合法性和完整性，并通知被告方參與訴訟。

2. 調(diào)解：法院會在案件受理后進行調(diào)解，希望雙方能夠通過協(xié)商解決爭議，達成和解協(xié)議。如果雙方達成和解，法院將根據(jù)和解協(xié)議的內(nèi)容予以執(zhí)行。

3. 審理：如果調(diào)解失敗或任何一方不同意和解，法院將進行案件審理。在審理過程中，法院會聽取雙方當事人的陳述、出示證據(jù)、質(zhì)證等，以了解案件的真實情況。

4. 判決：經(jīng)過審理后，法院將作出判決，根據(jù)事實和法律規(guī)定對合同糾紛案件做出裁決。判決書將明確雙方當事人的權(quán)利和義務(wù)，并給予被告履行合同的具體要求。

5. 強制執(zhí)行：如果被告方不履行判決書所要求的義務(wù)，法院會進行強制執(zhí)行。執(zhí)行程序包括查封、扣押財物、凍結(jié)銀行賬戶、拍賣財產(chǎn)等手段，以實現(xiàn)判決書的執(zhí)行。

需要注意的是，合同糾紛案件的執(zhí)行可能存在一定的變數(shù)，如財產(chǎn)難以執(zhí)行、被告方資產(chǎn)不足等。在這種情況下，法院可能需要采取其他措施，如裁定被告支付一定的賠償金或采取其他救濟措施，以保護原告的權(quán)益。

總之，合同糾紛案件在法院執(zhí)行過程中，法院將致力于保護當事人的合法權(quán)益，通過調(diào)解或判決來解決爭議，并在必要時采取強制執(zhí)行的措施確保判決書的有效執(zhí)行。