農(nóng)村自建房屬于違建，違反了國家土地利用政策和城鄉(xiāng)規(guī)劃法律法規(guī)。對于農(nóng)村自建房的違建問題，一般可以通過以下幾種方式進(jìn)行補(bǔ)辦。

首先，可以通過申請違章建筑合法化手續(xù)來補(bǔ)辦。申請人需要提供相關(guān)資料，包括自建房的建筑規(guī)劃、施工合同、施工圖紙、用地證明等，并繳納相應(yīng)的費用。政府相關(guān)部門將審核材料，如符合規(guī)定，可以給予違建項目違章建筑合法化審批通過，令其合法化。

其次，可以申請拆遷補(bǔ)償。政府相關(guān)部門會對一些非法建筑進(jìn)行拆除，拆遷遭到的損失可以通過拆遷補(bǔ)償來進(jìn)行補(bǔ)償。申請人需要提供相關(guān)證明材料，包括自建房的耕地證明、土地征收通知書、表決證明等。政府部門將按照相關(guān)規(guī)定進(jìn)行評估，確定補(bǔ)償金額，并進(jìn)行相應(yīng)的支付。

第三，可以依法進(jìn)行行政處罰。對于嚴(yán)重違章建筑的情況，政府相關(guān)部門可以根據(jù)相關(guān)法律法規(guī)進(jìn)行行政處罰，例如罰款、強(qiáng)制拆除等，以維護(hù)土地利用秩序和城鄉(xiāng)規(guī)劃。

最后，政府可以提供相關(guān)政策和救助。對于一些特殊情況下的違建，如因災(zāi)害損壞或家庭困難等原因，政府可以提供相應(yīng)的救助政策，如提供廉租房、補(bǔ)助金等。

需要注意的是，不同地區(qū)對于違建的補(bǔ)辦政策可能會有所不同，具體操作需要根據(jù)當(dāng)?shù)卣嚓P(guān)部門的規(guī)定進(jìn)行操作。此外，對于違建問題，建議民眾在自建房之前咨詢當(dāng)?shù)卣嚓P(guān)部門，以避免違法建筑的發(fā)生。