在國內(nèi)，合同糾紛的協(xié)調(diào)主要通過以下幾個部門：

1. 法院：法院是最權(quán)威的司法機構(gòu)，負責(zé)解決各類法律糾紛，包括合同糾紛。當(dāng)雙方在履行合同過程中出現(xiàn)爭議時，可以向法院提起訴訟，由法院根據(jù)法律和相關(guān)證據(jù)進行審判，并最終作出判決。

2. 仲裁機構(gòu)：仲裁機構(gòu)是另一種解決合同糾紛的機構(gòu)。當(dāng)雙方在合同履行中發(fā)生爭議時，可以通過協(xié)商的方式選擇一個具有公正性、中立性的仲裁機構(gòu)，由仲裁員進行調(diào)解，最終達成仲裁裁決，該裁決具有與法院判決相同的效力。

3. 行政部門：在一些特定的合同糾紛中，受害方可以向相關(guān)的行政部門尋求協(xié)調(diào)解決。例如，消費者與商家之間的合同糾紛，可以向工商行政管理部門投訴，由其進行調(diào)解和協(xié)調(diào)解決。

4. 專門性部門：有些合同糾紛可能涉及到專門的領(lǐng)域，如土地合同糾紛、建筑合同糾紛等。這類糾紛通常需要專門的部門進行協(xié)調(diào)解決，如土地行政部門、建筑行業(yè)協(xié)會等。

無論是選擇法院、仲裁機構(gòu)還是行政部門協(xié)調(diào)解決合同糾紛，雙方應(yīng)當(dāng)提供充分的證據(jù)材料，并按照相關(guān)程序履行義務(wù)。同時，可以尋求法律專業(yè)人士的幫助，理清合同糾紛的事實和法律關(guān)系，以提高解決糾紛的效率和準確性。

綜上所述，合同糾紛的協(xié)調(diào)主要通過法院、仲裁機構(gòu)、行政部門等部門進行。雙方應(yīng)當(dāng)根據(jù)具體情況選擇合適的協(xié)調(diào)機構(gòu)，并按照相關(guān)程序進行訴訟、仲裁或投訴，以求得公正、合法的解決方案。