廠房的違建認定主要依據(jù)以下幾個方面進行判斷：

1.建筑設計方面：廠房建設需要符合國家規(guī)定的建筑設計標準，包括建筑面積、建筑高度、建筑結構等方面的要求。如果建筑物存在超過規(guī)定建筑面積、高度等問題，就可以認定為違建。

2.土地使用方面：廠房建設需要獲得相應的土地使用證或土地出讓合同。如果廠房建設使用的土地證或土地合同無效、違規(guī)，或者存在土地使用性質與實際用途不符等情況，就可以認定為違建。

3.手續(xù)辦理方面：廠房建設需要獲得相應的建設工程規(guī)劃許可證、建設工程施工許可證等手續(xù)。如果企業(yè)在建設過程中沒有經(jīng)過相關的手續(xù)辦理，或者手續(xù)不齊全，就可以認定為違建。

4.環(huán)保方面：廠房建設需要符合環(huán)保要求，包括環(huán)境影響評價、排污許可證等方面。如果企業(yè)在建設過程中沒有按照環(huán)保法規(guī)進行評估和審批，或者存在環(huán)境污染等違規(guī)行為，就可以認定為違建。

5.違反城市規(guī)劃方面：廠房建設需要符合城市規(guī)劃要求，如建筑用地性質、建筑高度、建筑風貌等。如果建筑物違反城市規(guī)劃要求，就可以認定為違建。

當對廠房進行認定違建時，可以根據(jù)以上幾個方面進行綜合判斷，需要結合相關的證據(jù)和資料，如建筑設計圖紙、土地證、手續(xù)辦理記錄等，并有必要進行現(xiàn)場勘察和調查，最終得出是否違建的結論。