廠房上蓋房拆遷是指將廠房上方的房屋進行拆除或改建的過程。在進行廠房上蓋房拆遷時，相關部門通常會依法對被拆遷的房主進行補償。補償?shù)木唧w標準和方式會根據(jù)不同的地區(qū)和情況有所不同，但通常包括以下幾個方面的補償內(nèi)容：

1. 房屋補償：被拆遷的房主會根據(jù)房屋的性質(zhì)、面積、區(qū)位等因素進行補償。通常以按照市場價或相應標準進行計算，并支付給房主。

2. 搬遷費用補償：被拆遷的房主可能需要遷至其他地方居住，相關部門會提供搬遷費用的補償，包括搬家費、裝修費、交通費等。

3. 臨時居住費用補償：如果拆遷后房主需要在拆遷區(qū)域臨時居住，相關部門會提供相應費用的補償。

4. 生活補助費補償：相關部門可能會提供一定的生活補助費，以幫助被拆遷的房主度過拆遷期間的生活困難。

5. 就業(yè)安置補償：如果被拆遷的房主在拆遷過程中需要改變工作或職業(yè)，相關部門會提供一定的就業(yè)安置補償，包括職業(yè)培訓、就業(yè)崗位安排等。

在進行廠房上蓋房拆遷時，相關部門通常會根據(jù)法律法規(guī)進行補償，保障被拆遷房主的合法權益。被拆遷方應積極與相關部門溝通，提供相關證明資料并認真參與補償協(xié)商，以確保自身權益得到合理保障。同時，相關部門也應公正、透明地進行補償，并及時落實相關補償款項，以確保拆遷過程的公平性和合法性。